补发工资计入当年工资总额。依据《劳动合同法》等规定，经济补偿金按月应发工资算，含奖金、津贴等。不及时处理可能导致劳动者权益受损，引发劳动争议。
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补发工资算工资总额。具体操作：1. 若无争议，直接计入当年工资总额；2. 若有争议，先与劳动者协商；3. 协商不成，可申请劳动仲裁，依据裁决处理。
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补发工资通常计入工资总额。处理方式需根据具体情况定，如双方有争议，可协商或申请劳动仲裁。选择时应考虑效率与公平性，确保合法合规。