女方父亲案底通常不影响男方入党。法律分析：入党主要考察个人政治表现、道德品质等，女方父亲的案底属于其个人历史记录，除非涉及严重刑事犯罪且与男方有直接关联，否则不会影响男方的入党审查。若男方因此受到不公正对待，可能涉及歧视问题。提醒：若男方在入党过程中遭遇明显阻碍，且被明确告知因女方父亲案底所致，问题较为严重，应及时咨询专业人士。
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具体操作如下：1.若党组织对女方父亲案底提出疑问，男方应主动提供个人政治表现、道德品质等相关证明材料，并解释说明女方父亲案底与自身无关。2.如沟通后问题仍未解决，男方可咨询律师或相关法律机构，了解入党审查的具体规定及自身权益保护途径。3.若发现因女方父亲案底导致个人受到不公正对待，可依法向有关部门投诉或申请行政复议，必要时可提起诉讼维护个人合法权益。在整个过程中，保持冷静、理性沟通，确保问题得到妥善解决。
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法律分析：针对此类问题，常见处理方式有两种：一是积极沟通解释，向党组织说明情况，表明个人立场与女方父亲案底无直接关联；二是寻求法律援助或咨询，了解相关法律法规，确保个人权益不受侵犯。选择方式时，应根据具体情况判断，若沟通无果或遭遇不公，可考虑寻求法律途径。